Bourgelat projette de transférer l'Ecole de Lyon à Paris.
Décès de Jean-André Thouin, Jardinier du Cabinet du Roi. Son fils André lui succède. Il est nommé Jardinier en Chef du Cabinet Royal d'Histoire Naturelle (futur Museum d'Histoire Naturelle).
A Lyon, Honoré Fragonard réalise des travaux concernant les aspects toxiques de certains remèdes végétaux.

En octobre l'Ecole Royale Vétérinaire d'Alfort ouvre ses portes. Le "Jardin des Plantes" est déjà prêt. Fragonard en est le professeur. Les 90 élèves identifient les Simples, aident à leur culture, les récoltent, les sèchent, préparent des extraits, les distillent, afin de préparer les drogues (médicaments). Comme à Lyon, le jardin a un rôle de premier plan dans la thérapeutique vétérinaire. Honoré Fragonard en surveille le bon entretien et dispense les cours de Botanique et de "matières médicales" (pharmacie).

Dans ce Jardin on cultive aussi des plantes destinées aux humains. Dès le départ il y a donc une connotation "ethno-botanique". Pour seconder Fragonard on nomme un Chef de Botanique, M. Bredin.

M. Chalmat, jardinier est remplacé par M. Boulogne. François Fragonard dit Fragonard-cadet seconde son frère dans la gestion de la Pharmacie.

A la suite d'antipathies réciproques entre Bourgelat et Fragonard, ce dernier quitte l'Ecole. Ses travaux d'anatomie sont publiés par Bourgelat qui s'en approprie la paternité...

Le "Jardin d'Hygiène" expose des plantes nutritives, salutaires et nuisibles. M. Courbebaisse, qui a remplacé Fragonard, classe les Plantes selon le système de Joseph Pitton de Tournefort. On construit une serre d'hivernage.

Pierre Marie Auguste Broussonet est reçu Docteur en Médecine à L'Université de Médecine et de Pharmacie de Montpellier (c'est donc aussi un botaniste). Il deviendra un naturaliste aux connaissances très complètes et sera nommé Secrétaire Perpétuel de l'Académie d'Agriculture et de l'Académie des Sciences. - L'élève et disciple d'André Thouin, M. Germain Millet est nommé Chef Jardinier à l'EnvA.

Buffon envoie M. Daubenton (son protégé), Professeur d'Economie rurale au Jardin Royal et au Collège Royal ainsi que M. Broussonet à Alfort afin de créer une Chaire à l'instar du Museum. Ils en deviennent titulaires et sont chargés d'enseigner leurs sciences et la culture des plantes médicinales et économiques aux élèves de l'Ecole, aidés en cela par un Professeur, M. Gilbert.

Broussonnet crée la Société Linéenne de Paris avec 6 de ses amis et collègues (Lavoisier, Redouté, Daubenton, Desfontaines, Fourcroy et Thouin). Entre-temps il a été nommé directeur du Jardin des Plantes de Montpellier (425 ans en 2018), et a été élu à l'unanimité (fait rarissime) à l'Académie des Sciences de Paris. Il introduit le premier Ginkgo biloba à Montpellier et peut-être le premier Broussonetia papyrifera ainsi que le Cercis siliquastrum (Arbre de Judée) qui figurait encore dans le Jardin de la Direction en 1957. Le trésor royal est vide : les crédits pour l'Ecole sont réduits.

Les arbres forestiers qui ont été fournis par le Trianon (Versailles) périclitent faute d'avoir pu s'enraciner.

Le Jardin d'herbes est changé de place. On y entretient alors 1600 espèces classées selon le système Baillon (on y trouve quelques plantes malgaches car Baillon a séjourné à Madagascar).

Les grandes inondations. L'ENVA est envahie par les eaux. Au cours des années suivantes quelques points bas sont surélevés avec d'énormes apports de mâchefer, ce qui oblige à creuser jusqu'à 1m de profondeur parfois et de remplir le trou de bonne terre avant de planter un nouvel arbre !